Поздравляем с успешной защитой докторской!!!

03 декабря 2014

Сорокин Павел Борисович 

успешно защитил свою докторскую диссертацию!

От всей души поздравляем и желаем дальнейших научных успехов!!!

Ты смог, ты сумел, ты добился! 

Защита прошла, как по маслу! 

Ты к этому годы стремился, 

Теперь же победу ты празднуй! 

Поздравляем тебя мы сердечно,

Диссертацию ты защитил,

Это было не просто конечно,

Все же сделал ты то, что решил.

Мы гордимся твоим достижением!

Ты теперь уже доктор наук,

Эта степень не будет последней,

Стань профессором, наш верный друг! 

Касательно семинаров

Мы обзавелись собственным каналом на youtube.com. И первыми видео, добавленными на наш канал, стали замечательные доклады двух ведущих ученых, сделанных на проводимом нами семинаре "Современное теоретическое и экспериментальное материаловедение" (17.10.2014). 

Доклад проф. Д.В. Гольберга 

Nanomaterial Property Studies Using Modern In Situ TEM Techniques

Доклад проф. А.В. Крашенинникова

2D Transition-Metal Dichalcogenides: Doping, Alloying and Electronic Structure Engineering

Не так давно в Сети поднялся шум по поводу "зажимания" русских учёных западными журналами (см. например). Нам кажется, что эти слухи несколько преувеличены. И если в случае действительно "крутых" журналов возможно имеет место ненаучная выборка известных авторов из известных институтов, то в случае крепких середнячков и ниже такого точно нет. И если ваши результаты интересны, если они оформлены грамотно, если исходная гипотеза подтверждена и теорией, и экспериментом, то статью вы опубликуете. В пользу этого говорят наши многочисленные публикации в самых разных научных журналах с импакт-фактором от 2 до 15.
И вообще, лучше всего по поводу этой ситуации высказался М.И.Кацнельсон в своём ЖЖ:

Подавляющее большинство научной продукции - это УГ, которое, по большому счету, можно печатать, можно не печатать, и никому от этого ни холодно, ни жарко. Кроме авторов и членов их семей, но, в конце концов, способы, которыми люди зарабатывают себе на пропитание, это отдельная тема, к науке как таковой отношения не имеющая. Единственный способ сделать и опубликовать что-то важное - это вылизывать и вылизывать работу, так, чтобы даже если бы весь мир был против, ее было бы нельзя игнорировать. Каждый нормальный научный работник сталкивается с такими проблемами без всякой политики (есть "борьба школ", есть задачи с очень неоднозначной репутацией, есть области, где все со всеми перегрызлись), и единственный достойный путь - это делать то, что зависит от себя, то есть, повышать качество своих работ, и будь что будет. Жалобы на "не печатают" - очень серьезный дисквалифицирующий признак для научного работника, еще хуже, чем ссылки на желтую прессу (типа нынешних Известий) в качестве серьезного источника информации. Поощрение настроений "мы такие великие, а весь мир против нас" есть лучший способ убить науку в стране, куда более эффективный, чем любые санкции, даже если таковые и существуют. Как всегда, страшны не санкции, а ответ на них. Бедный Воронеж, его все бомбят и бомбят.

Собственно, это не про науку даже. Это про самоощущение "меня опять обидели", которое есть духовное самоубийство. Это, блин, нормально, что весь мир против, а ты все-таки делаешь свое дело. Как мне, совсем тогда молоденькому, говорил один из лучших физиков предыдущего поколения, "вот когда вам все говорят - ерунда, ерунда, - а вы все-таки сделали и доказали, вот это и есть настоящее дело". Мамардашили еще в "Психологической топологии пути" писал, что внешние проблемы нужно решать через решение внутренних, а не наоборот. Не он первый, понятно, но формулировка простая и должна, по идее, легко запоминаться."

Так что, коллеги, за работу. Ныть нам точно времени нет.

Общемосковский семинар
«Теоретическое и экспериментальное материаловедение»

Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН (http://ibcp.chph.ras.ru/) и Технологический институт сверхтвердых и новых углеродных материалов (http://tisnum.ru/) начинают серию научных семинаров по вопросам теоретического и экспериментального материаловедения. 

Ближайший семинар состоится 17 октября в конференц-зале ИБХФ РАН.

На данном семинаре будут сделаны доклады ведущих учёных работающих в области теоретического и экспериментального материаловедения:

проф. А.В. Крашенников (University of Helsinki, Aalto University, Finland), «2D Transition-Metal Dichalcogenides: Doping, Alloying and Electronic Structure Engineering»

проф. Д.В. Гольберг (MANA, NIMS, Tsukuba University, Japan), «Nanomaterial Property Studies Using Modern In Situ TEM Techniques»

Начало семинара: 15:00

Окончание семинара: 17:00

Место проведения: Семинар будет проходить в конференц-зале Института биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН по адресу ул. Косыгина д.4 (станция метро Ленинский проспект).

На конференцию приглашаются все желающие. Участие в конференции – бесплатное.

Программа конференции и регистрация участников: http://ibcp.chph.ras.ru/seminar/

Язык семинара: русский.

Организаторы: лаборатория акустической микроскопии ФГБУН ИБХФ РАН, лаборатория теоретического моделирования ФГБНУ ТИСНУМ

По всем вопросам обращаться к секретарю семинара Любови Антипиной (lyuantipina@tisnum.ru)

Семинарам посвящается...

Все когда-то были м.н.с.-ами, и профессора из Японии, и снс из Троицка... Разве что названия различались...

Научный семинар

Уважаемые коллеги!
В понедельник, 15 сентября 2014 г. в 15-00 в конференц-зале ФГБНУ ТИСНУМ состоится
научный семинар. Тема доклада:

«Quantum chemical investigations of carbon nanostructures and their formation mechanisms»

Докладчик:

Prof. Stephan Irle 

(Department of Chemistry,
Nagoya University, Japan)

Проф. Стефан Ирле занимался исследованиями по квантовой химии и моделированию наноматериалов в научных центрах Германии, Австрии, США и Японии. Он является специалистом в быстро растущей области квантово-химических расчетов методом молекулярной динамики (QM/MD) сложных химических реакций. Большую часть его исследований представляет собой изучение процессов самосборки и разрушения различных наноструктур, включая исследования химических реакций и молекулярных свойств материалов, а также разработку методологий для QM/MD.

Любишь ли ты науку так, как ее любим мы?

Международный симпозиум в Москве

С 13 по 18 июля в Москве, в МГУ проходил международный симпозиум по наноматериалам NANO2014, в котором также принимали участие члены теоретической группы. 

Фотография с сайта NANO2014

На конференции присутствовали ведущие мировые ученые: Harold Kroto, James Tour, Dmitri Golberg и др. Нашими коллегами были представлены устные доклады на тему исследования фазовых переходов в квазидвумерных алмазных пленках нанометровой толщины. 

Конференция была очень пафосной, проходила в новом корпусе Московского университета, называемом Ломоносовским корпусом

Фотография с сайта NANO2014

Всем участникам конференции были выданы флэшки с материалами конференции, записанными на флэшке, т.к. они содержат в себе более 1000 страниц тезисов участников. Масштаб конференции был невероятен, поэтому она была названа нами симпозиумом. 

Каждый день на протяжении работы конференции проходили 11 параллельных секций по самым разным тематикам, при этом, в первой половине дня проходили постерные сессии.

Фотография с сайта NANO2014

Конференция прошла удачно и продуктивно, о чем свидетельствуют новые научные контакты и приобретенный опыт.

Кофе брейки (Фотография с сайта NANO2014)

Конференция по двумерным материалам

В начале июля г. Дублин (Ирландия) проходила международная конференция Flatlands: Beyond Graphene 2014, в которой принимал участие сотрудник теоретической группы Александр Квашнин. На конференции был представлен устные доклад по исследованию образования сверхтонких графеноподобных пленок ионного состава.

Неподдельный интерес к докладу был вызван ведущими учеными в области двумерных материалов, такими как Reshef Tenne, Gotthard Seifert, Yuri Gogtsi и др. Помимо этого был приобретен бесценный опыт публичных выступлений.

Конференция проходила в Trinity College, являющимся одним из старейших и самых престижных высших учебных заведений Ирландии. Располагается кампус в самом центре Дублина. Символом университета является часовня (изображена ниже), которая находится на центральной площади кампуса.

 Также на территории кампуса находится одна из старейших библиотек. В ней хранятся книги, написанные еще в 9 веке. В настоящее время библиотека является музеем, где проходят экскурсии.

Защита

2 июля 2014 года прошла защита квалификационных диссертационных работ на степень бакалавра. В нашей группе появился новоиспеченный бакалавр - Ерохин Сергей, Ура!
Немного фото с выступления:

Google автокреатив сделал анимацию

После успешной отличной защиты наступила торжественная часть внутри нашего коллектива, где мы все поздравляли Сергей с успешной защитой.

Летняя Суперкомпьютерная Академия

С 23 июня по 4 июля на базе ВМК и НИВЦ МГУ проходит Летняя Суперкомпьютерная Академия, в которой принимают участие сотрудники нашей группы.
Наши коллеги прошли отбор для обучения по трекам Технологии параллельного программирования MPI и OpenMP и Высокопроизводительные вычисления на кластерах с использованием графических ускорителей NVIDIA.

LiveSlides о нашей недавней работе

В начале июня появилась презентация нашей опубликованной статьи Radiation-Induced Nucleation of Diamond from Amorphous Carbon: Effect of Hydrogen в JPCL. В презентации говорится об основных идеях образования наноалмазов из антрацитового и суббитуминозного угля посредством химически индуцированного фазового перехода, а также обсуждаются результаты, полученные в работе.
Прослушать презентацию можно по ссылке 

Новая работа

В середине мая в свет вышла новая статья сотрудников нашей теоретической группы совместно с коллегами из Rice University, опубликованная в Journal of Physical Chemistry Letters, в которой экспериментально был подтвержден эффект химически-индуцированного фазового перехода, который был теоретически предсказан нашей группой.

МинОбр обозначил цели

"Около 30 000 статей российских авторов в журналах, индексируемых в Web of Science, порядка 25 тысяч разработок, ориентированных на промышленное применение, а также рост процентного соотношения числа исследователей до 39 лет в общей массе учёных, прорыв двух российских вузов в топ-200 мировых образовательных рейтингов, трудоустройство не менее половины выпускников профессиональных организаций по специальности уже в первый год после получения диплома. Таких результатов ждёт Министерство образования и науки РФ от подведомственного сектора по итогам 2014 года. Об этом стало известно 14 мая на заседании Общественного совета при министерстве." (ссылка)
 
Эти цели кажутся достижимыми. Особенно если учесть, что в 2011 году число публикаций в РФ составляло чуть более 22000 (ссылка). Эта величина (как и заявленные 30000) намного ниже, чем у передовых стран (США: 310 206, Китай: 142 645 и пр. см. нижеследующую диаграмму)

Таким образом, как мне кажется, скорость роста научной активности нашей страны должна быть значительно выше, если мы хотим войти в число научных лидеров. А развитие нашей страны просто обязывает это.
Также необходимо учесть качество научных публикаций, нельзя гнаться за простым количеством статей. А этого нельзя достичь без радикального улучшения научного климата (хотя признаки этого ощущаются).

Появление наших вузов в топ 200 также выглядит реалистичным, хотя бы просто потому, что до программы 5-100 ВУЗы не стремились попасть в них и просто не публиковали многие формальные показатели, добавляющие очки в международных рейтингах. Тем более что объективно наше образование остаётся на хорошем уровне - наши специалисты по прежнему очень востребованы в зарубежным центрах.
Тут тоже, как мне кажется, амбициозность задач не соответствует требуемому развитию страны. Не два ВУЗа, а в десятки должны стремиться в эти рейтинги.

Развитие науки жизненно важно для России. И замечательно, что наше правительство начало это осознавать. Но мы должны стремиться к большему!

С Днем Победы!

С Праздником Великой Победы, Товарищи!

Оптимизация

Немного про то, как можно увеличить скорость работы программ в Matlab. Хотя Matlab автоматически регулирует размеры векторов и матриц, оказывается, что лучше будет предварительно выделить матрицы. Такое предварительное распределение берет на себя расходы на выделение памяти только один раз, и это гарантирует, что матричные элементы будут храниться в смежных ячейках оперативной памяти (по столбцам).
Рассмотрим следующий код:

clear all;
nx = 50000;
dx = 5;
for i = 1:nx
x(i) = (i-1)*dx;
y(i) = sin(3*x(i));
end

Это неоптимизированный код, так как размер массивов x и y будет увеличиваться с каждым проходом цикла, что будет увеличивать время работы. Так, его время работы составляет 1.97 сек. Но, мы знаем размеры наших массивов в большинстве случаев, поэтому можно заранее выделить под них память:

clear all;
nx = 50000;
dx = 5;
x = zeros(1,nx);
y = zeros(1,nx);
for i = 1:nx
x(i) = (i-1)*dx;
y(i) = sin(3*x(i));
end

Время работы этого кода составляет 0.001999 сек., что намного быстрее.
Далее можно еще немного подоптимизировать его. Теперь вектора x (i), и y (i) тоже будут использовать преимущества векторизации.
Оптимальнее всего будет написать вот так:

clear all;
nx = 50000;
dx = 5;
x = zeros(1,nx);
y = x;
for i = 1:nx
x(i) = (i-1)*dx;
y(i) = sin(3*x(i));
end

Собственно, эта оптимизация не намного уменьшила время работы (0.00198 сек.)
Такие простые способы оптимизации кода помогут значитально уменьшить время работы приложений и сократить затраты памяти :)

Сладковские чтения

Сегодня в Институте элементоорганических соединений им. А.Н.Несмеянова Российской академии наук (ИНЭОС РАН) проходило 68-е заседание "Сладковских чтений". Сладковские чтения - это общемосковский коллоквиум по физическим и физико-химическим свойствам карбина и других форм углерода, который организован в 1981г. известным химиком проф. А.М.Сладковым (1922-1982гг.).
Сегодня, на 68 заседание выступал руководитель теоретической группы ФГБНУ ТИСНУМ к.ф.-м.н. Сорокин Павел Борисович с докладом "Новые квазидвумерные графеноподобные пленки на основе ионных соединений".

Устанавливаем программы

Работа теоретика, который занимается моделированием, связана не только с исследованием материалов и структур, проведением расчетов и анализом полученных данных, но и с установкой того оборудования, в данном случае, программного обеспечения, которое позволило бы все это делать.
Таким образом, кроме знаний физики, квантовой механики, химии и т.д. необходимо уметь и знать, как установить ту или иную программу на вычислительную машину. Большинство кластеров и расчетных компьютеров управляются ОС Linux и ее разновидностями, следовательно, необходимо уметь с ней работать.
Установка программы под ту или иную систему требует времени, упорства  и знаний.
Ниже я приведу ссылки, где описана установка программного пакета LAMMPS:

На компьютер с Linux Ubuntu:
http://alex-hpc.blogspot.ru/2012/08/lammps-ubuntu.html

На кластер с CentOS 6.2:
http://alex-hpc.blogspot.ru/2012/08/lammps-centos-62.html

На гибридный кластер CPU+GPU под управлением CentOS 6.2:
http://alex-hpc.blogspot.ru/2014/03/lammps-gpu.html

Конечно, процесс установки индивидуален, и не факт, что в одном месте установится также, как и в предыдущем, но найти такие подробные инструкции по установке программы в интернете - бесценно :)

Печально, но факт

"Ученому-теоретику не позавидуешь. Ведь природа, точнее эксперимент, - неумолимый и не очень дружелюбный судья его работы. Он никогда не говорит теории "Да". В лучшем случае он говорит "Возможно", а в подавляющем большинстве случаев - просто "Нет". Если опыт согласуется с теорией, это означает для теории "Возможно"; если не согласуется, это означает "Нет".
Вероятно, каждая теория рано или поздно услышит свое "Нет", а большинство теорий слышит это сразу после рождения".
(А. Эйнштейн, 11 ноября 1922 г.)

Что сегодня, на ваш взгляд, является основой успешной научной карьеры?

Наткнулся на опрос проводимый на сайте МИСиС
http://science.misis.ru/ru/polls/?VOTE_ID=3

Результаты его приведены на этой диаграмме

И хотя выборка здесь совсем не репрезентативна (проголосовало около 200 человек) результаты вполне типичны - самое главное для продвижения в науке это не талант, не трудолюбие и даже не интеллект (хотя он на почётном втором месте). Главное - близость к тем, у кого власть в науке.
Надеюсь, эта порочная ситуация будет скоро изменена. Пока во главе нашей науки находятся не блестящие учёные, а "эффективные менеджеры" - не видать нам нового технологического скачка.

Полезное для экспериментаторов

На одной из конференций раздавали вот такой буклет:

Идея, в принципе, кажется неплохой. И если это действительно заработает, то это здорово может форсировать международное сотрудничество. Главным препятствием, кажется, извечная проблема нежелания делиться своими образцами и идеями, что очень часто гробит потенциально отличные работы.
www.sampleofscience.net

Кластер

В распоряжении группы находится высокопроизводительный вычислительный кластер Т-Платформа на базе T-Blade 1.1 для проведения моделирования свойств углеродных материалов с помощью специализированного программного обеспечения.  

Характеристики кластера:

- Количество шасси T-Blade V205S: 1

- Количество вычислительных лезвий: 10

- Количество CPU: 20 

- Количество ядер: 320 

- Пиковая производительность x_86_64: (Rpeak) = 2.94 TFLOPS с двойной точностью 

- CPU: 20 x CPU AMD Opteron 6276, 16-core, 2.3 GHz, cache 8x2 MB L2, 16 MB L3, TDP 15

- RAM: 1280 GB (4 GB per core)

- HDD: 16 TB (SAS) + 10 TB (SATA 7.2K)

- Системная сеть: QDR InfiniBand (up to 40 Gb/sec)

- Сервисная сеть: Gigabit Ethernet

- ОС: Linux CentOS 6.2

Наши связи

Наша группа сотрудничает с ведущими мировыми научно-исследовательскими группами. 

Карта нашего сотрудничества изображена на рисунке ниже.

СМИ про нас

Опубликовать хорошую работу в хорошем журнале - это успех для любого человека, серьезно занимающегося наукой. Однако, важно еще признание того, что твоя работа важна и интересна не только самим авторам, но и окружающим людям. О таком интересе можно говорить, когда работай начинают интересоваться средства массовой информации. Наша группа не является исключением, про нас и про наши исследования тоже писали и пишут. Здесь вкратце расскажу о том какие из наших работ вызвали резонанс в научном сообществе